Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TK1P04183 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TK1P04183 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TK1P04183 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TK1P04183 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TK1P04183 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TK1P04183 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TK1P04183 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TK1P04183 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TK1P04183 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TK1P04183 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TK1P04183 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TK1P04183 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TK1P04183 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TK1P04183 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TK1P04183 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TK1P04183 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TK1P04183 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TK1P04183 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TK1P04183 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TK1P04183 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TK1P04183 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TK1P04183 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TK1P04183 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TK1P04183 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TK1P04183 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TK1P04183 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TK1P04183 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TK1P04183 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TK1P04183 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TK1P04183 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TK1P04183 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TK1P04183 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TK1P04183 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TK1P04183 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TK1P04183 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TK1P04183 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TK1P04183 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TK1P04183 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TK1P04183 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TK1P04183 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TK1P04183 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TK1P04183 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TK1P04183 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TK1P04183 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TK1P04183 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TK1P04183 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TK1P04183 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TK1P04183 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TK1P04183 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TK1P04183 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TK1P04183 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TK1P04183 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TK1P04183 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TK1P04183 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TK1P04183 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TK1P04183 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TK1P04183 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TK1P04183 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TK1P04183 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TK1P04183 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TK1P04183 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TK1P04183 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TK1P04183 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TK1P04183 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TK1P04183 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TK1P04183 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TK1P04183 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TK1P04183 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TK1P04183 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TK1P04183 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TK1P04183 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TK1P04183 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TK1P04183 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TK1P04183 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TK1P04183 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TK1P04183 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TK1P04183 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TK1P04183 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TK1P04183 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TK1P04183 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TK1P04183 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TK1P04183 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TK1P04183 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TK1P04183 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TK1P04183 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TK1P04183 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TK1P04183 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TK1P04183 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TK1P04183 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TK1P04183 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TK1P04183 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TK1P04183 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TK1P04183 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TK1P04183 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TK1P04183 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TK1P04183 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TK1P04183 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TK1P04183 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TK1P04183 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms