Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GFRA3O60609 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFRA3O60609 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms