Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK2O60296 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK2O60296 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAK2O60296 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms