Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BUD23O43709 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BUD23O43709 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BUD23O43709 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BUD23O43709 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BUD23O43709 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BUD23O43709 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BUD23O43709 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BUD23O43709 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BUD23O43709 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BUD23O43709 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BUD23O43709 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BUD23O43709 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BUD23O43709 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BUD23O43709 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BUD23O43709 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BUD23O43709 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BUD23O43709 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BUD23O43709 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BUD23O43709 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BUD23O43709 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BUD23O43709 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BUD23O43709 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BUD23O43709 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BUD23O43709 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BUD23O43709 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BUD23O43709 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BUD23O43709 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BUD23O43709 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BUD23O43709 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BUD23O43709 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BUD23O43709 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BUD23O43709 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BUD23O43709 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BUD23O43709 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BUD23O43709 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BUD23O43709 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BUD23O43709 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BUD23O43709 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BUD23O43709 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BUD23O43709 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BUD23O43709 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BUD23O43709 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BUD23O43709 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BUD23O43709 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BUD23O43709 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BUD23O43709 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BUD23O43709 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BUD23O43709 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BUD23O43709 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BUD23O43709 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BUD23O43709 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BUD23O43709 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BUD23O43709 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BUD23O43709 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BUD23O43709 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BUD23O43709 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BUD23O43709 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BUD23O43709 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BUD23O43709 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BUD23O43709 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BUD23O43709 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BUD23O43709 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BUD23O43709 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BUD23O43709 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BUD23O43709 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BUD23O43709 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BUD23O43709 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BUD23O43709 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BUD23O43709 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BUD23O43709 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BUD23O43709 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BUD23O43709 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BUD23O43709 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BUD23O43709 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BUD23O43709 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BUD23O43709 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BUD23O43709 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BUD23O43709 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BUD23O43709 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BUD23O43709 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BUD23O43709 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BUD23O43709 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BUD23O43709 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BUD23O43709 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BUD23O43709 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BUD23O43709 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BUD23O43709 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BUD23O43709 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BUD23O43709 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BUD23O43709 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BUD23O43709 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BUD23O43709 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BUD23O43709 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BUD23O43709 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BUD23O43709 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BUD23O43709 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BUD23O43709 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BUD23O43709 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BUD23O43709 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms