Protein–RNA interactions for Protein: O14843

FFAR3, Free fatty acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR3O14843 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FFAR3O14843 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FFAR3O14843 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms