Protein–RNA interactions for Protein: O00469

PLOD2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD2O00469 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLOD2O00469 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLOD2O00469 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms