Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TULP2O00295 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TULP2O00295 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TULP2O00295 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TULP2O00295 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TULP2O00295 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TULP2O00295 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TULP2O00295 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TULP2O00295 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TULP2O00295 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TULP2O00295 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TULP2O00295 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TULP2O00295 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TULP2O00295 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TULP2O00295 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TULP2O00295 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TULP2O00295 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TULP2O00295 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TULP2O00295 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TULP2O00295 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TULP2O00295 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TULP2O00295 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TULP2O00295 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TULP2O00295 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TULP2O00295 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TULP2O00295 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TULP2O00295 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TULP2O00295 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TULP2O00295 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TULP2O00295 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TULP2O00295 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TULP2O00295 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TULP2O00295 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TULP2O00295 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TULP2O00295 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TULP2O00295 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TULP2O00295 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TULP2O00295 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TULP2O00295 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TULP2O00295 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TULP2O00295 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TULP2O00295 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TULP2O00295 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TULP2O00295 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TULP2O00295 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TULP2O00295 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TULP2O00295 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TULP2O00295 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TULP2O00295 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TULP2O00295 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TULP2O00295 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TULP2O00295 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TULP2O00295 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TULP2O00295 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TULP2O00295 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TULP2O00295 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TULP2O00295 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TULP2O00295 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TULP2O00295 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TULP2O00295 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TULP2O00295 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP2O00295 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP2O00295 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP2O00295 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP2O00295 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP2O00295 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP2O00295 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP2O00295 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP2O00295 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP2O00295 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP2O00295 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TULP2O00295 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TULP2O00295 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TULP2O00295 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TULP2O00295 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TULP2O00295 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TULP2O00295 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP2O00295 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP2O00295 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP2O00295 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP2O00295 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP2O00295 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP2O00295 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP2O00295 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP2O00295 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP2O00295 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP2O00295 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP2O00295 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP2O00295 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP2O00295 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP2O00295 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP2O00295 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP2O00295 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP2O00295 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TULP2O00295 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TULP2O00295 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TULP2O00295 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TULP2O00295 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TULP2O00295 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TULP2O00295 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms