Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMD9O00233 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMD9O00233 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMD9O00233 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMD9O00233 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMD9O00233 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMD9O00233 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMD9O00233 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMD9O00233 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMD9O00233 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMD9O00233 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD9O00233 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD9O00233 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms