Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD12O00232 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD12O00232 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms