Protein–RNA interactions for Protein: M0QZC1

RNF225, RING finger protein 225, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF225M0QZC1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF225M0QZC1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF225M0QZC1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF225M0QZC1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF225M0QZC1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF225M0QZC1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF225M0QZC1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF225M0QZC1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF225M0QZC1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms