Protein–RNA interactions for Protein: H7C1H1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1H1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H7C1H1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H7C1H1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H7C1H1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H7C1H1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H7C1H1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H7C1H1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H7C1H1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H7C1H1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H7C1H1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H7C1H1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H7C1H1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H7C1H1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H7C1H1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H7C1H1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H7C1H1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H7C1H1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H7C1H1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H7C1H1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H7C1H1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H7C1H1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H7C1H1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H7C1H1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H7C1H1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H7C1H1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H7C1H1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H7C1H1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H7C1H1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H7C1H1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H7C1H1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H7C1H1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H7C1H1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H7C1H1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H7C1H1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H7C1H1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H7C1H1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H7C1H1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H7C1H1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H7C1H1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H7C1H1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H7C1H1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H7C1H1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H7C1H1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
H7C1H1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H7C1H1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H7C1H1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H7C1H1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H7C1H1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
H7C1H1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H7C1H1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H7C1H1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H7C1H1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H7C1H1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H7C1H1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H7C1H1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H7C1H1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H7C1H1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H7C1H1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H7C1H1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H7C1H1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H7C1H1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H7C1H1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H7C1H1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H7C1H1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H7C1H1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H7C1H1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H7C1H1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H7C1H1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H7C1H1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H7C1H1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H7C1H1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H7C1H1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H7C1H1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H7C1H1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H7C1H1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H7C1H1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H7C1H1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H7C1H1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H7C1H1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H7C1H1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H7C1H1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H7C1H1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H7C1H1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H7C1H1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H7C1H1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H7C1H1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H7C1H1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H7C1H1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H7C1H1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H7C1H1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H7C1H1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H7C1H1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H7C1H1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H7C1H1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H7C1H1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H7C1H1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H7C1H1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H7C1H1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
H7C1H1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H7C1H1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms