Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
E9PCH4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
E9PCH4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
E9PCH4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
E9PCH4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
E9PCH4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
E9PCH4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
E9PCH4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
E9PCH4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
E9PCH4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
E9PCH4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
E9PCH4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
E9PCH4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
E9PCH4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
E9PCH4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
E9PCH4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
E9PCH4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
E9PCH4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
E9PCH4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
E9PCH4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
E9PCH4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
E9PCH4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
E9PCH4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
E9PCH4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
E9PCH4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
E9PCH4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
E9PCH4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
E9PCH4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
E9PCH4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
E9PCH4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
E9PCH4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
E9PCH4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
E9PCH4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
E9PCH4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
E9PCH4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
E9PCH4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
E9PCH4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
E9PCH4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
E9PCH4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
E9PCH4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
E9PCH4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
E9PCH4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
E9PCH4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
E9PCH4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
E9PCH4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
E9PCH4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
E9PCH4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
E9PCH4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
E9PCH4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
E9PCH4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
E9PCH4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
E9PCH4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
E9PCH4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
E9PCH4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
E9PCH4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
E9PCH4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
E9PCH4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
E9PCH4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
E9PCH4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
E9PCH4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
E9PCH4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
E9PCH4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
E9PCH4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
E9PCH4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
E9PCH4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
E9PCH4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
E9PCH4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
E9PCH4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
E9PCH4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
E9PCH4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
E9PCH4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
E9PCH4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
E9PCH4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
E9PCH4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
E9PCH4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
E9PCH4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
E9PCH4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
E9PCH4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
E9PCH4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
E9PCH4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
E9PCH4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
E9PCH4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
E9PCH4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
E9PCH4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
E9PCH4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
E9PCH4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
E9PCH4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
E9PCH4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
E9PCH4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
E9PCH4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
E9PCH4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
E9PCH4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
E9PCH4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
E9PCH4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
E9PCH4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
E9PCH4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
E9PCH4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
E9PCH4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
E9PCH4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
E9PCH4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms