Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPBD1B2RD01 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPBD1B2RD01 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms