Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A6NL46 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A6NL46 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A6NL46 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A6NL46 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A6NL46 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A6NL46 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A6NL46 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A6NL46 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A6NL46 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A6NL46 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A6NL46 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A6NL46 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A6NL46 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A6NL46 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
A6NL46 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
A6NL46 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A6NL46 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NL46 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NL46 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NL46 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NL46 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NL46 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NL46 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NL46 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NL46 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NL46 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NL46 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NL46 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NL46 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NL46 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NL46 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A6NL46 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A6NL46 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A6NL46 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A6NL46 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
A6NL46 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A6NL46 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A6NL46 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A6NL46 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A6NL46 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A6NL46 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A6NL46 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
A6NL46 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A6NL46 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A6NL46 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A6NL46 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A6NL46 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A6NL46 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A6NL46 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NL46 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NL46 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NL46 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NL46 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NL46 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NL46 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NL46 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NL46 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NL46 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NL46 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NL46 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NL46 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NL46 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NL46 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A6NL46 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A6NL46 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A6NL46 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A6NL46 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A6NL46 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A6NL46 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A6NL46 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A6NL46 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A6NL46 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A6NL46 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
A6NL46 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A6NL46 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A6NL46 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A6NL46 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
A6NL46 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A6NL46 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A6NL46 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A6NL46 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A6NL46 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A6NL46 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A6NL46 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A6NL46 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
A6NL46 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A6NL46 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A6NL46 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A6NL46 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A6NL46 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A6NL46 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A6NL46 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A6NL46 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A6NL46 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
A6NL46 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A6NL46 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A6NL46 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A6NL46 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A6NL46 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms