Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4D1N5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4D1N5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4D1N5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4D1N5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4D1N5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4D1N5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4D1N5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4D1N5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4D1N5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4D1N5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4D1N5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4D1N5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4D1N5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4D1N5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4D1N5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A4D1N5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A4D1N5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A4D1N5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A4D1N5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A4D1N5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4D1N5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4D1N5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4D1N5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4D1N5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4D1N5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4D1N5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4D1N5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4D1N5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4D1N5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4D1N5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4D1N5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4D1N5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4D1N5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4D1N5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4D1N5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4D1N5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4D1N5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4D1N5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4D1N5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A4D1N5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
A4D1N5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4D1N5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4D1N5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4D1N5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4D1N5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4D1N5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4D1N5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4D1N5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4D1N5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4D1N5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4D1N5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A4D1N5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4D1N5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4D1N5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4D1N5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4D1N5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4D1N5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4D1N5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4D1N5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4D1N5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4D1N5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4D1N5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4D1N5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4D1N5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4D1N5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A4D1N5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A4D1N5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4D1N5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4D1N5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4D1N5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4D1N5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4D1N5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4D1N5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4D1N5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4D1N5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A4D1N5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4D1N5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4D1N5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4D1N5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4D1N5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4D1N5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4D1N5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4D1N5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4D1N5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4D1N5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4D1N5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4D1N5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4D1N5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4D1N5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4D1N5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4D1N5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4D1N5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4D1N5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4D1N5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4D1N5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A4D1N5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A4D1N5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4D1N5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4D1N5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms