Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSZ9

TRAV30, T-cell receptor alpha variable 30 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV30A0A087WSZ9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAV30A0A087WSZ9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAV30A0A087WSZ9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms