Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms