Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms