Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms