Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP13Q92995 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP13Q92995 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP13Q92995 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP13Q92995 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP13Q92995 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP13Q92995 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP13Q92995 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP13Q92995 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP13Q92995 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP13Q92995 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP13Q92995 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP13Q92995 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP13Q92995 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP13Q92995 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP13Q92995 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP13Q92995 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP13Q92995 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP13Q92995 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP13Q92995 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP13Q92995 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP13Q92995 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP13Q92995 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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