Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTTNBP2Q8WZ74 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms