Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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