Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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