Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms