Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4BQ13620 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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