Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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