Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF5Q12774 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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