Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms