Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ACTA1P68133 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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