Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms