Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FNTBP49356 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FNTBP49356 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FNTBP49356 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FNTBP49356 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FNTBP49356 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FNTBP49356 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FNTBP49356 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FNTBP49356 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FNTBP49356 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FNTBP49356 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms