Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ME1P48163 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ME1P48163 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ME1P48163 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ME1P48163 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ME1P48163 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ME1P48163 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ME1P48163 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ME1P48163 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ME1P48163 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms