Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGCXP38435 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGCXP38435 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms