Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINB3P29508 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms