Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PLNP26678 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
PLNP26678 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PLNP26678 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PLNP26678 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms