Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAPGEF3O95398 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms