Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LCHNA4D1U4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms