Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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