Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLCO1B3Q9NPD5 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms