Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COG4Q9H9E3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms