Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms