Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHMP6Q96FZ7 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms