Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms