Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCL2Q8N4E4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms