Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CATSPER4Q7RTX7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms