Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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ATG16L1Q676U5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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ATG16L1Q676U5 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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ATG16L1Q676U5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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ATG16L1Q676U5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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ATG16L1Q676U5 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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ATG16L1Q676U5 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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ATG16L1Q676U5 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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ATG16L1Q676U5 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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ATG16L1Q676U5 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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ATG16L1Q676U5 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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