Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR44Q5JSH3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms