Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms