Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDCCQ504Y2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms