Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR2Q2VWA4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR2Q2VWA4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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